一项慢乙肝和艾滋病感染者研究中，替诺福韦酯相关的脊柱和髋部骨密度平均下降0.98%和2.54%。这不是丙酚替诺福韦的结果。丙酚替诺福韦已被批准用于肾小球滤过率大于15的慢性乙肝患者。
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与替诺福韦相关、需要了解的主要不良事件是骨密度降低、肾小管功能障碍和肾功能不全。下面先写替诺福韦酯，再写英文缩写TAF的丙酚替诺福韦。0.98%和2.54%不是丙酚替诺福韦的下降幅度。
在慢乙肝和艾滋病感染者中，一项研究发现脊柱和髋部骨密度平均下降0.98%和2.54%。这组数字属于该研究里使用替诺福韦酯的下降幅度。骨密度下降会增加这些部位骨折的风险。使用阿德福韦酯或替诺福韦酯的人，髋部骨折风险高于使用拉米夫定的人，也高于没有使用抗病毒治疗的人。这一比较没有给出百分率。骨密度下降与磷酸盐经肾脏排出增加有关，对成年人的影响较小，但会随服药时间累积；对儿童可能更明显，因此替诺福韦酯应避免用于儿童。
丙酚替诺福韦对骨密度的影响小于替诺福韦酯。对比研究中，髋部和脊柱骨密度降低的风险明显低于替诺福韦酯，推测与有效成分剂量更小有关。这一段没有给出丙酚替诺福韦自己的下降百分率。
替诺福韦酯可能使部分患者肾功能恶化，肾功能已经减退时宜避免使用。损伤包括近端肾小管功能障碍、急性肾损害和慢性肾脏病。复查中可见血清肌酐升高、蛋白尿、尿糖阳性、低磷血症和急性肾小管坏死。在艾滋病感染者中，有研究提到替诺福韦酯可能引起范可尼综合征和终末期肾病，并有死亡个案。短期对比里，恩替卡韦和替诺福韦酯的肾损害安全性没有明显差距；用药时间越长，替诺福韦酯的肾损害越突出。需要持续监测肾功能、尿常规、β2微球蛋白和血磷。
丙酚替诺福韦的肾毒性小于替诺福韦酯。美国食品药品监督管理局已批准它用于肾小球滤过率大于15的慢性乙肝患者。与替诺福韦酯相比，抗病毒效果相近。肾毒性和骨毒性较小，是因为用药量更少、血浆中替诺福韦浓度更低，同时外周血单核细胞内的替诺福韦双磷酸盐浓度更高。使用期间仍要监测不良反应。
