近一半耐药患者（35%至45%）是因为BCR-ABL激酶域突变。一项单臂试验招募449人，有效率分析纳入444人。慢性期主要细胞遗传学反应为55%，其中耐药或不耐受组51%、T315I组70%。
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对酪氨酸激酶抑制剂耐药的原因分成两类。一类与BCR-ABL融合基因无关，例如SRC激酶家族激活、细胞遗传学克隆进化、费城染色体阳性慢性髓细胞白血病细胞出现额外染色体异常，以及静息干细胞。另一类与BCR-ABL有关，例如融合基因突变，或该基因扩增、过表达。普纳替尼可抑制BCR-ABL产生的ABL，以及T315I突变的ABL，半数抑制浓度分别为0.4纳摩尔每升和2.0纳摩尔每升。机制数据把它列为T315I突变ABL的抑制剂。其他半数抑制浓度在0.1至20纳摩尔每升的靶点包括：SRC激酶家族（SRC、LCK、YES、FYN），血管内皮生长因子受体家族，血小板衍生生长因子受体家族，成纤维细胞生长因子受体家族，EPH受体家族，干细胞因子受体c-KIT，以及RET、TIE2和FLT3受体。
近一半耐药患者（35%至45%）是因为BCR-ABL融合基因发生突变，位置在ABL1的酪氨酸激酶结构域。其余较小一部分是该基因扩增、过表达，或其他与BCR-ABL无关的原因。
一项单臂、开放标签、全球多中心试验按病期和突变情况分组：慢性期慢性髓性白血病、加速期、急变期或费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病、对既往酪氨酸激酶抑制剂耐药或不能耐受，以及T315I突变。慢性期的主要终点是主要细胞遗传学反应，包括完全和部分细胞遗传学反应。加速期、急变期和费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病的主要终点是主要血液学反应，定义为完全血液学反应，或没有白血病证据。试验招募449人，参与有效率分析的有444人。5人因为没有接受过达沙替尼或尼洛替尼，且缺少T315I突变状态的确认，未纳入有效率分析。444人中，慢性期267人，其中耐药或不耐受组203人、T315I突变组64人；加速期83人，急变期62人，费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病32人。
分析时中位随访37.3个月。仍在治疗的133人中，慢性期110人、加速期20人、急变期3人；这些仍在治疗的人最低随访时间为48个月。中位治疗时间分别为慢性期32.2个月、加速期19.4个月、急变期2.9个月、费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病2.7个月。慢性期总体主要细胞遗传学反应为55%，耐药或不耐受组51%，T315I组70%；完全细胞遗传学反应分别为46%、40%和66%；主要分子反应分别为39%、34%和58%。达到主要细胞遗传学反应和主要分子反应的中位时间分别为2.8个月（1.6至11.3个月）和5.5个月（1.8至47.4个月）。
加速期、急变期和费城染色体阳性急性淋巴细胞白血病的主要血液学反应分别为57%、31%和41%，完全血液学反应分别为51%、21%和34%。三组达到主要血液学反应的中位时间分别为0.7个月（0.4至5.8个月）、1.0个月（0.4至3.7个月）和0.7个月（0.4至5.5个月）。上述缓解比例来自这一项耐药或不耐受、各病期及T315I突变患者的试验。
